O principal objetivo do Sistema de Governança Corporativa no Complexo de Saúde Pequeno Cotolengo é estabelecer um conjunto eficiente de mecanismos nos termos da legislação, regulamentação e nos documentos organizacionais, que assegure uma administração alinhada aos interesses das Partes Interessadas de forma ética, íntegra, transparente e sustentável, e assim, garantir o cumprimento dos princípios básicos de governança corporativa.

O Complexo de Saúde Pequeno Cotolengo é administrado pelos seguintes órgãos: Assembleia Geral, Conselho Consultivo, Conselho Provincial, Conselho Fiscal, Diretoria Estatutária e Diretoria Executiva.